JR北海道などによると、4月13日07:55、北朝鮮が発射したミサイルが北海道周辺に落下するものとみられるとするJ-ALERT国民保護関連情報配信を受け、北海道新幹線は安全確認のため、新青森〜新函館北斗駅間で運転を見合わせていましたが、08:19までに運転再開し、一部列車に最大20分程度の遅れが出ています。
なお政府はその後、Em-Net緊急情報ネットワークシステムで、北海道周辺へのミサイル落下可能性はなくなったと訂正発表しています。
≪新幹線運行状況≫
■北海道新幹線
・下り線(北行) はやて93号 約20分遅れ
・上り線(南行) はやぶさ14号 約15分遅れ