JR東日本の運行情報によると、1月1日に発生した能登半島地震の影響で4日、JR越後線が越後赤塚－関屋の上下線で終日運転を見合わせる。内野－新潟大学前の線路脇で陥没が見つかったためで、運転再開は1月6日昼ごろを目指すとしている。
1月4日は柏崎－越後赤塚、関屋－新潟で折り返し運転する。バスなどによる代行輸送は行わないとしている。
また、越後線の復旧作業の影響で、JR弥彦線の弥彦ー東三条の一部列車に運休や遅れが発生している。
JR西日本の運行情報によると、JR大糸線は1月5日まで、南小谷（長野県）－糸魚川で終日運転を取りやめる。運転再開は6日午後以降を予定している。地震で線路設備に被害が出たためで、代行輸送は行わない。
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