JR西日本によると、6日は強風のため、JR湖西線は午前8時ごろから同11時ごろまで、近江舞子（滋賀県大津市）ー近江塩津（長浜市）間で列車の運転を取り止めていたが、風が弱まったため、11時17分に運転を再開した。夕方以降、強風が見込まれているため、午後3時ごろから同9時ごろまで和邇ー近江塩津間の運転を一時的に見合わせた。
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和邇ー近江塩津間は6日午後9時24分に運転再開した。特急「サンダーバード」は米原経由に経路変更し、迂回運転するため遅れが発生。
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【運転見合わせ（午後3時ごろから同9時ごろ）前の最終列車】
＜京都駅・近江今津駅⇒近江塩津駅方面＞
・京都駅 午後0時45分発 新快速 敦賀行き
＜京都駅・近江舞子駅⇒近江今津駅方面＞
・京都駅 午後1時26分 普通 近江今津行き
＊近江舞子駅からは、午後2時16分発 新快速 近江今津行きとして運転
＜京都駅・和邇駅⇒近江舞子駅方面＞
・京都駅 午後3時41分 普通 近江舞子行き
＜近江塩津駅⇒京都駅方面＞
・近江塩津駅 午後1時40分 新快速 姫路行き
＜近江舞子駅⇒京都駅方面＞
・近江舞子駅 午後4時34分 普通 京都行き
■新快速は、京都～近江塩津間で運転を取り止める
■大阪と北陸を結ぶ特急「サンダーバード」号は、米原経由（琵琶湖線）に運転経路を変更して、う回運転をするため、各駅到着に20～40分程度の遅れが発生する
