長崎県などは28日、県内16市町で計363人の新型コロナウイルス感染者を確認したと発表した。350人を超えるのは6月3日公表以来。また県は28日に更新した県内の新型コロナ陽性者のゲノム（全遺伝情報）解析で、オミクロン株の派生型「BA・5」が初めて確認されたことを明らかにした。
県の解析によると、5月以降、同じ派生型の「BA・2」に100％置き換わっていたが、6月5～11日に採取した検体のうち1件が「BA・5」だった。感染力は「BA・2」より強いとされるが、予防には従来通りの換気やマスク着用が有効という。
28日発表のうち、新規クラスター（感染者集団）は8件。長崎市では民間児童福祉施設2カ所でそれぞれ9人と5人、放課後児童クラブで5人、市立小2カ所でそれぞれ7人と5人の陽性が確認された。佐世保市では児童関係施設で園児8人、高齢者福祉施設で入所者8人と職員3人から陽性を確認。五島市では障害福祉サービス事業所で利用者10人、職員3人が陽性だった。
28日、長崎市では市立小3校の3学級、佐世保市では市立学校8校で1学年と9学級をそれぞれ閉鎖した。
佐世保市は米海軍佐世保基地で27日までに基地関係者（軍人、軍属ら）7人の感染が判明したと発表した。
26日時点の県内のワクチン接種状況は1回目が82.4％、2回目が81.2％、3回目が64.7％。
