京都市は天神川の氾濫危険が極めて高いとして、午後0時10分現在で、北区の柏野、大将軍、衣笠、金閣学区と中京区の朱雀第四、朱雀第八、朱雀第二学区、右京区の安井、山ノ内学区、上京区の仁和、翔鸞学区に避難指示を出している。
その後、左京区吉田、錦林東山、岡崎、浄楽、北白川、修学院学区と東山区の粟田、弥栄、六原学区にも発表された。
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京都市は19日午後3時50分に、北区の柏野、大将軍、衣笠、金閣学区、上京区の仁和、翔鸞学区、中京区の朱雀第四、朱雀第八、朱雀第二学区、右京区の安井、山ノ内学区の避難指示を解除した。
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京都市は20日午後10時22分、市内すべての避難指示を解除した。