JR西日本、JR東海によると1月1日午後4時10分に発生した地震に伴い、東海道新幹線や北陸新幹線、上越新幹線は運転を見合わせている。えちぜん鉄道は同日午後5時半現在、安全の確認が取れるまで全線で運転を取りやめている。
地震に伴い特急サンダーハードは地震以降、すべて運休になった。JR西日本の北陸エリアで運転を見合わせている路線は以下の通り。
北陸本線:近江塩津―金沢
高山本線:猪谷―富山
氷見線:高岡―氷見
城端線:高岡―城端
七尾線:金沢―和倉温泉
越美北線（九頭竜線）:福井―九頭竜湖
小浜線:敦賀―東舞鶴
